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En 1873, le ministre de l'instruction publique lui confiait une mission 
pour étudier l'organisation des laboratoires de pisciculture de l’Europe. 
Au retour de sa mission, en 1876, il publiait son Traité de piscicul- 
ture pratique et d’aquiculture, sous le patronage de Michel Chevalier, 
qui le présenta au public dans une introduction magistrale. Ce livre 
contenait une description détaillée du fonctionnement de tous les éta- 
blissements de pisciculture de l’Europe dignes de mention et était 
accompagné de considérations générales sur les avantages devant dé- 
couler, pour l'alimentation publique, du développement de cette science. 
En même temps, Bouchon-Brandely poursuivait activement ses re- 
cherches sur la génération des Mollusques. Après avoir suivi avec le 
plus vif intérèt toutes les phases du développement de l’industrie 
ostréicole dans le bassin d'Arcachon, il concevait le projet de créer 
d’autres centres ostréicoles sur différents points de notre littoral. S’as- 
sociant aux efforts de l’administration de la marine, à qui l’on doit, — 
l'impartialité oblige à le reconnaitre, — la création et le développement 
de l’ostréiculture en France, Bouchon-Brandely encouragea les popula- 
tions du Croisic à transformer leurs marais salants en parcs d'élevage, 
et imprima une vive impulsion à la culture des huîtres portugaises sur 
les rives de la Gironde et à l'embouchure de la Seudre. 
En 1882, il devenait le collaborateur de l’éminent professeur Charles 
Robin, à la commission sénatoriale de repeuplement des eaux. Chargé 
d’une inspection sur les rives de la Méditerranée, il étudiait avec le 
plus grand soin le fonctionnement de la pêche, signalait les abus à 
réprimer, la règlementation nouvelle à édicter. 
Le rapport qu'il publia à la suite de cette mission lui donna, comme 
il se plaisait à le dire familiérement, ses lettres de grande naturalisa- 
tion dans le monde scientifique. 
Tant d'efforts persévérants ne manquèrent pas d'attirer sur lui l’atten- 
tion du gouvernement. 
En 1883, le ministre de la marine le chargea d’une mission à Tahiti 
pour étudier la situation des lagons, où se reproduit la Pintadine, ce 
mollusque précieux qui fournit la nacre et les pierres fines. Il visita 
successivement les Tuamotu, les Gambier, les iles sous le Vent, tous 
les archipels, dont les richesses risquaient d’être compromises par lin- 
curie des indigènes. Le rapport qu'il publia, au retour de sa mission, 
montrait le parti merveilleux qu’on pouvait tirer de ces mollusques en 
leur appliquant les méthodes de reproduction artificielle. Un règlement 
inspiré par ses conseils, et actuellement en vigueur dans nos possessions 
océaniennes, a sauvé des richesses immenses d’une ruine certaine. 
En 1887, l’amiral Aube, alors ministre de la marine, ayant songé à 
rétablir l'inspection générale des pêches maritimes, qui n'avait pas eu 
de titulaire depuis la mort de M. Coste, appela Bouchon-Brandely à ces 
hautes fonctions. 
Se préoccupant plus que jamais d'ouvrir à l’industrie ostréicole de 
