836 
Fishery Bulletin 96(4), 1 998 
Table 5 
DNA sequences of cytochrome b of 12 individuals of Scomber , and Rastrelliger kanagurta , with reading frame indicated. 
Reported sequences of S. japonicus from Italy 1 and S. scombrus, sequences nos. 3 and 5, are from Finnerty and Block (1992). 
Indicated positions are relative to the full-length human mitochondrial DNA sequence 2 (Anderson et al., 1981). A‘.’ indicates 
identity to sequence number 1, and a represents missing data. 
Species 
GenBank 
Haplotype 
15085 
15100 
1 
R. kanagurta 
AF032704 
Unknown 
ta 
gaa 
aca tga 
aac 
ate 
gga 
gtt 
g-- 
2 
R. kanagurta 
AF032705 
Unknown 
3 
S. scombrus 
L11544 
Unknown 
t 
g. - 
• -g 
g. . 
. . t 
. . a 
. tc 
4 
S. scombrus 
AF032706 
S-MAS94 
• -g 
g. . 
. . t 
. . a 
. tc 
5 
S. japonicus (Italy) L11546 
Unknown 
t 
a . g 
- -g 
. . t 
. . t 
. .g 
.tt 
6 
S. japonicus 
AF032707 
J-CAL15 
c 
a . g 
. . t 
. . t 
. -g 
.tt 
7 
S. japonicus 
AF032708 
J-CAL14 
a.g 
. . t 
. . t 
• -g 
. tt 
8 
S. australasicus 
AF032709 
A-RED62 
• g 
. . t 
— 
— 
— 
9 
S. australasicus 
AF032710 
A-RED60 
gt 
. . a 
. tt 
10 
S. australasicus 
AF032711 
A-AUS71 
c 
a.g 
. . t 
. .t 
. . a 
. tt 
11 
S. australasicus 
AF032712 
A-MEX79 
. . t 
. . a 
.tt 
12 
S. australasicus 
AF032712 
A-MEX81 
. . t 
. . a 
. tt 
15115 
15130 
15145 
15160 
1 
2 
ctt etc etc 
tta gta 
atg 
ata 
acc 
get ttc 
gtt 
ggc 
tac 
gtc ctt 
ccc 
tga 
gga 
caa 
atg 
3 
. . c 
c . c ... 
• -g 
. . t 
. . c ... 
4 
. . c 
c . c ... 
- -g 
. . t 
. . c ... 
5 
c . c ... 
. . a 
. . a ... 
. . C 
. . t 
6 
c . c ... 
. . a 
. . a ... 
. . c 
. . c 
7 
c . c ... 
. . a 
. . a ... 
. . c 
. . c 
8 
— — — 
c . c ... 
. . a 
. . a ... 
. . c 
. . t 
9 
c . c ... 
. . a 
. . a ... 
. . c 
. . t 
10 
c . c ... 
. . a 
. . a ... 
. . c 
. . c 
11 
c . c ... 
. . a 
. . a ... 
. . c 
. . c 
. . a 
12 
c . c ... 
. . a 
. . a ... 
. . c 
. . c 
. . a 
15175 
15190 
15205 
15220 
1 
2 
tec ttc tga 
ggt gca 
act 
gtc 
att 
act aac 
etc 
Ctt 
tcc 
gca gtc 
cct 
tat 
gta 
ggc 
act 
3 
. . a . . c 
. . c 
. . a 
. . c 
. . a 
t 
. . a 
. . c 
. . a 
4 
. .g . .c 
. . c 
. . a 
. . c 
. . a 
t 
. . a 
. . c 
. . a 
5 
. .g . .c 
- -g • • • 
. . a 
. . c 
. .g 
. . a 
. . c 
. . t 
. . t 
6 
. .g . .c 
. . c 
. . a . . t 
. . a 
. . a 
. . a 
. . c 
. . c 
. . t 
7 
• -g • -c 
. . c 
. . a . . t 
. . a 
• -g 
. . a 
. . c 
. . c 
. . t 
8 
. . a . . c 
. . a ... 
. . a 
• -g 
. . a 
. . c 
. . c 
. . t 
9 
. . a . . c 
. . a ... 
. . a 
• -g 
. . a 
. . c 
. . c 
. . t 
10 
• -g • -c 
. . c 
. . a ... 
. . a 
• -g 
. . a 
. . c 
. . c 
. . t 
11 
. .g . .c 
. . c 
. . a ... 
. . a 
• • g 
. . a 
. . c 
. . t 
12 
• -g • -c 
. . c 
. . a ... 
. . a 
• -g 
. . a 
. . c 
. . t 
15235 
15250 
15265 
15280 
1 
2 
ace eta gta 
gaa tga 
ate 
tga 
ggt 
ggc ttc 
tcc 
gtc 
gac 
aat gca 
acc 
etc 
act 
ega 
ttc 
3 
. . a . . c . . t 
. . t 
• -g 
. . a 
. . a 
t 
• -g 
• -g 
4 
. . a . . c . . t 
. . t 
• -g 
. . a 
. . a 
t 
• -g 
• -g 
5 
. . a . . c . . t 
• -g • • • 
. . C 
. . a 
. . a 
c 
. . c 
6 
c . . t 
• -g ••• 
. . C 
. . a 
. . a 
... t . c 
. . c 
7 
c . . t 
. .g ... 
. . c 
. . a 
. . a 
c 
. . c 
8 
. . a . . c . . t 
. .g ... 
. . c 
. . a 
. . a 
c 
. . c 
9 
. . a . . c . . t 
. .g ... 
. . c 
. . a 
. . a 
c 
. . c 
10 
. . a . . c . . t 
. . g ... 
. .g 
. . c 
. . a 
. . a 
c 
. . c 
11 
. . a . . c . . t 
. . g ... 
. . c 
. . a 
. . a 
c 
. . c 
12 
. . a . . c . . t 
. .g ... 
. . c 
. . a 
. . a 
c 
. . c 
continued on next page 
