Fishery Bulletin 96(4), I99F 
Small et al.. Population and stock indentification of Oncorhyrtchus kisutch 
847 
Table 1 
Allele frequencies, observed heterozygosity (Hobs) and expected heterozygosity (Hexp) at Ots 101 and OtsS loci i for coho salmon populations 
region with region names abbreviated as follows: Central Coast (C Coast), North Coast Vancouver Island (NCVI), West Coast Vancouver Island 
Populations out of Hardy-Weinberg equilibrium are indicated by * next to the observed heterozygosity. The allele number (in basepairs i is the 
al. (1998), Table 3. Sample sizes for Ots 101 are given underneath the population names and for Ots 3 are indicated by N . ^ 
Alleles 
Pallant Atnarko Kitimat C Coast Cluxewe Stephens Waukwaas NCVI Nitmat Robertson WCVI Quinsam 
93 87 148 235 38 65 30 133 39 84 123 160 
Ots 101 
96 
100 
104 
108 
112 
116 
0 
0.016 
0.005 
0.016 
0.054 
0.022 
0.034 
0.011 
0.011 
0.011 
0.029 
0 
0.014 
0.051 
0.014 
0.037 
0.064 
0.021 
0.036 
0.013 
0.028 
0.051 
0 
0.053 
0.053 
0.039 
0.013 
0 
0 
0.031 
0.077 
0.031 
0.008 
0.023 
0 
0.017 
0.067 
0.083 
0.017 
0 
0 
0.034 
0.068 
0.045 
0.011 
0.011 
0 
0 
0 
0 
0.103 
0 
0.065 
0.030 
0 
0 
0.036 
0.071 
0.045 
0.021 
0 
0 
0.057 
0.049 
0 
0.003 
0.003 
0.019 
0.072 
0.051 
120 
0.065 
0.138 
0.081 
0.098 
0.092 
0.023 
0.017 
0.041 
0.051 
0 
0.016 
0.081 
124 
0.141 
0.092 
0.088 
0.088 
0.171 
0.131 
0.101 
0.135 
0 
0.042 
0.028 
0.084 
127 
0.091 
0.075 
0.057 
0.064 
0.066 
0.008 
0.051 
0.034 
0 
0.054 
0.037 
0.097 
131 
0.124 
0.098 
0.095 
0.094 
0.145 
0.108 
0.101 
0.117 
0.141 
0.024 
0.061 
0.151 
135 
0.027 
0.006 
0.031 
0.021 
0.013 
0.038 
0.017 
0.026 
0.091 
0.071 
0.077 
0.019 
139 
0.081 
0.011 
0.031 
0.024 
0.013 
0.054 
0.067 
0.045 
0.051 
0.054 
0.053 
0.041 
143 
0.032 
0.011 
0.024 
0.019 
0.039 
0.069 
0.033 
0.053 
0.013 
0.083 
0.061 
0.063 
147 
0.011 
0.017 
0.041 
0.032 
0.079 
0.123 
0 
0.083 
0.205 
0.149 
0.167 
0.022 
151 
0.022 
0.011 
0.010 
0.011 
0 
0.054 
0.017 
0.030 
0.051 
0.054 
0.053 
0.009 
154 
0.011 
0.006 
0.027 
0.019 
0.039 
0.015 
0.017 
0.023 
0.013 
0 
0.004 
0.003 
158 
0.011 
0.029 
0.047 
0.041 
0.013 
0 
0.017 
0.008 
0.077 
0.012 
0.033 
0.019 
161 
0.027 
0.034 
0.027 
0.031 
0 
0.008 
0.051 
0.015 
0.064 
0.125 
0.106 
0.041 
165 
0 
0.069 
0.021 
0.038 
0 
0.023 
0.051 
0.023 
0.026 
0.048 
0.041 
0.059 
169 
0 
0.046 
0.047 
0.047 
0.053 
0 
0 
0.015 
0.038 
0.048 
0.045 
0.069 
173 
0.048 
0.040 
0.057 
0.051 
0.026 
0.008 
0.101 
0.034 
0.013 
0 
0.004 
0.031 
177 
0.043 
0.057 
0.017 
0.031 
0.013 
0.046 
0.117 
0.053 
0.038 
0.012 
0.021 
0.022 
181 
0.038 
0.052 
0.041 
0.045 
0.039 
0.054 
0 
0.038 
0 
0.006 
0.004 
0.009 
185 
0 
0.034 
0.037 
0.036 
0.026 
0.038 
0 
0.026 
0 
0.012 
0.008 
0.019 
189 
0 
0.040 
0.021 
0.028 
0.013 
0 
0 
0.004 
0 
0.006 
0.004 
0 
193 
0.005 
0.006 
0.021 
0.015 
0 
0.015 
0.017 
0.011 
0 
0 
0 
0 
197 
0.027 
0 
0 
0 
0 
0 
0.017 
0.004 
0 
0 
0 
0 
201 
0.016 
0.011 
0 
0.004 
0 
0 
0.017 
0.004 
0 
0 
0 
0.009 
205 
0.032 
0.011 
0.003 
0.006 
0 
0 
0.017 
0.004 
0.013 
0 
0.004 
0.003 
210 
0.016 
0.006 
0.003 
0.004 
0 
0.015 
0 
0.008 
0 
0 
0 
0 
215 
0.032 
0.011 
0 
0.004 
0 
0 
0 
0 
0.013 
0 
0.004 
0.003 
Hobs 
0.861 
*0.862 
0.909 
0.885 
0.921 
0.877 
0.967 
0.909 
0.718 
0.869 
0.821 
0.900 
Hexp 
Ots3 
0.935 
0.943 
0.946 
0.945 
0.921 
0.938 
0.933 
0.939 
0.897 
0.940 
0.927 
0.931 
N 
93 
86 
145 
231 
38 
68 
32 
138 
40 
84 
124 
160 
66 
0.129 
0.052 
0.045 
0.048 
0 
0.029 
0.109 
0.040 
0.013 
0.012 
0.012 
0 
68 
0.005 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
70 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
72 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
74 
0.011 
0 
0.007 
0.004 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
76 
0 
0 
0.003 
0.002 
0.013 
0 
0 
0.004 
0 
0 
0 
0 
78 
0 
0.035 
0.003 
0.015 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
82 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
84 
0 
0 
0.014 
0.009 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0.025 
86 
0.027 
0.285 
0.124 
0.184 
0.079 
0.051 
0.063 
0.062 
0.112 
0.024 
0.052 
0.125 
88 
0.258 
0.215 
0.328 
0.286 
0.316 
0.191 
0.234 
0.236 
0.275 
0.179 
0.211 
0.281 
90 
0.071 
0.017 
0.003 
0.009 
0.013 
0.059 
0.047 
0.043 
0 
0.221 
0.149 
0.034 
92 
0.011 
0.012 
0.066 
0.045 
0.092 
0.141 
0.078 
0.112 
0.151 
0.101 
0.117 
0.019 
94 
0.323 
0.251 
0.238 
0.242 
0.368 
0.419 
0.234 
0.362 
0.138 
0.292 
0.242 
0.338 
96 
0 
0.017 
0.024 
0.022 
0.039 
0.007 
0.047 
0.025 
0 
0.006 
0.004 
0.003 
98 
0.145 
0.116 
0.124 
0.121 
0.066 
0.051 
0.094 
0.065 
0.313 
0.161 
0.211 
0.166 
100 
0.016 
0 
0.003 
0.002 
0 
0.029 
0.016 
0.018 
0 
0.006 
0.004 
0.006 
102 
0.005 
0 
0.017 
0.011 
0.005 
0.078 
0.013 
0.033 
0 
0 
0 
0.003 
104 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
106 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
Hobs 
0.699 
0.698 
*0.752 
0.732 
0.816 
0.765 
0.751 
0.775 
0.751 
0.786 
0.774 
0.712 
Hexp 
0.790 
0.800 
0.809 
0.763 
0.765 
0.875 
0.789 
0.775 
0.798 
0.814 
0.762 
British Columbia. The weighted mean of allele frequencies for regions 1 in bold type ) follow allele frequencies for individual populations in the 
ivcvi i, East Coast Vancouver Island (ECVI), Skeena River (Skeenal, Nass River (Nass), Thompson River (TRl, and lower Fraser River (L Fr). 
)W e, l mit of the allele bin. Allele frequencies for individual populations in the lower Fraser River and the Thompson River are given in Small et 
Big 
juab'-um ECVI 
200 2 60 
Toboggan 
164 
Cedar 
47 
Babine 
139 
Clear- 
water 
48 
Sustut 
36 
Skeena 
434 
Tseax 
40 
Zolzap 
47 
Mexiadin 
64 
Nass 
151 
TR 
1015 
L Fr 
1043 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0.0 i 
0.007 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0.013 
0 
0 
0.004 
0 
0.018 
0.0 ’ 
0.014 
0.018 
0 
0.029 
0.010 
0.028 
0.020 
0.013 
0.011 
0.063 
0.022 
0 
0.009 
o.o. ' 
0.022 
0.015 
0.053 
0.068 
0.063 
0.056 
0.045 
0.025 
0.096 
0.078 
0.059 
0.001 
0.037 
0 
0.032 
0.003 
0.021 
0.004 
0.021 
0.042 
0.010 
0.025 
0.021 
0.031 
0.026 
0.001 
0.011 
0.01 - 
0.028 
0.165 
0.149 
0.032 
0.042 
0.125 
0.104 
0.162 
0.138 
0.078 
0.114 
0.077 
0.034 
0.0k* 
0.084 
0.186 
0.138 
0.273 
0.302 
0.181 
0.220 
0.151 
0.074 
0.172 
0.129 
0.015 
0.122 
0.08 
0.082 
0.049 
0.138 
0.137 
0.031 
0.056 
0.084 
0.101 
0.096 
0.078 
0.088 
0.001 
0.082 
0.0b ; 
0.088 
0.003 
0.043 
0.011 
0.073 
0 
0.017 
0.051 
0.011 
0.078 
0.037 
0.007 
0.112 
0.13 ‘ 
0.139 
0.076 
0.074 
0.007 
0.115 
0.014 
0.052 
0.025 
0.064 
0.023 
0.037 
0.071 
0.119 
0.05-: 
0.039 
0.031 
0.085 
0.094 
0.011 
0.028 
0.054 
0.151 
0.117 
0.016 
0.088 
0.011 
0.121 
0.063 
0.053 
0.006 
0.043 
0.011 
0.031 
0 
0.014 
0.025 
0.021 
0.023 
0.022 
0.014 
0.073 
0.025 
0.042 
0 
0.053 
0 
0.031 
0 
0.009 
0.013 
0.021 
0.016 
0.011 
0 
0.042 
0.013 
0.019 
0.003 
0.043 
0 
0.021 
0.028 
0.010 
0.075 
0.043 
0.031 
0.051 
0.002 
0.048 
0.02 7 
0.019 
0.006 
0.011 
0.004 
0.031 
0 
0.008 
0.013 
0.032 
0 
0.015 
0.019 
0.027 
0.035 
0.021 
0.006 
0 
0 
0.011 
0 
0.003 
0 
0.106 
0 
0.037 
0.051 
0.021 
0.013 
0.015 
0 
0 
0.004 
0 
0.014 
0.002 
0 
0.011 
0.008 
0.007 
0.011 
0.011 
0.013 
0.028 
0 
0.011 
0 
0.042 
0.028 
0.008 
0.013 
0.021 
0 
0.011 
0.081 
0.033 
0.05-3 
0.058 
0 
0.043 
0 
0.021 
0.014 
0.008 
0 
0 
0.039 
0.015 
0.056 
0.011 
0.045 
0.054 
0.031 
0 
0.022 
0.011 
0 
0.020 
0.050 
0.021 
0.016 
0.029 
0.159 
0.005 
0.051 
0.041 
0.064 
0.021 
0.141 
0.063 
0.014 
0.075 
0 
0.064 
0.055 
0.048 
0.111 
0.011 
0.006 
0.013 
0.046 
0.011 
0.051 
0.021 
0.069 
0.041 
0 
0 
0.086 
0.040 
0.086 
0.005 
0.005 
0.007 
0.031 
0.011 
0.018 
0.031 
0.111 
0.030 
0.013 
0.011 
0.047 
0.029 
0.091 
0.006 
0.013 
0.015 
0.052 
0.032 
0.058 
0.052 
0.097 
0.055 
0.038 
0 
0 
0.011 
0.076 
0.009 
0.013 
0.007 
0.119 
0.011 
0.029 
0 
0.056 
0.060 
0.038 
0.011 
0.055 
0.040 
0.026 
0.013 
0.027 
0.015 
0.082 
0 
0.011 
0 
0.042 
0.038 
0.025 
0.011 
0.008 
0.015 
0.017 
0.008 
0.035 
0.019 
0.009 
0 
0 
0.021 
0 
0.006 
0 
0 
0 
0 
0.006 
0.011 
0.011 
0.011 
0.003 
0.011 
0 
0 
0 
0.002 
0.013 
0.011 
0.016 
0.015 
0.007 
0.003 
0.045 
0.026 
0 
0 
0.004 
0.011 
0 
0.002 
0 
0 
0 
0 
0.001 
0.001 
0 
0 
0.003 
0 
0 
0 
0 
0.001 
0 
0 
0 
0 
0.001 
0.001 
0 
0.001 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0.001 
0 
0.885 
0.889 
0.835 
0.809 
0.853 
0.813 
0.806 
0.822 
0.851 
0.883 
0.844 
0.821 
0.881 
0.874 
0.935 
0.936 
0.902 
0.915 
0.871 
0.915 
0.892 
0.902 
0.925 
0.936 
0.718 
0.914 
0.915 
0.915 
191 
351 
161 
48 
139 
47 
37 
432 
39 
46 
52 
137 
1016 
1048 
0.065 
0.036 
0.012 
0.021 
0.108 
0 
0.068 
0.047 
0.013 
0.033 
0.048 
0.033 
0 
0.034 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0.001 
".003 
0.001 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0.003 
0 
0 
0 
0 
0.001 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
>011 
0.006 
0.003 
0 
0 
0 
0 
0.001 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0.011 
0 
0.002 
0 
0.022 
0 
0.007 
0 
0 
0.005 
0.003 
0 
0.011 
0 
0 
0 
0.002 
0 
0 
0 
0 
0 
0.001 
0.016 
0.021 
0.006 
0.031 
0 
0 
0.054 
0.010 
0.051 
0.011 
0.011 
0.022 
0 
0.004 
0.102 
0.113 
0.065 
0.229 
0.111 
0.128 
0.271 
0.132 
0.154 
0.272 
0.125 
0.182 
0.011 
0.082 
0.209 
0.241 
0.181 
0.156 
0.227 
0.181 
0.054 
0.182 
0.103 
0.174 
0.163 
0.150 
0.125 
0.249 
0.045 
0.041 
0.102 
0 
0.065 
0.053 
0.041 
0.068 
0.077 
0.076 
0.067 
0.073 
0.078 
0.051 
0.071 
0.047 
0.009 
0.021 
0.007 
0.011 
0.108 
0.019 
0.167 
0.011 
0.115 
0.095 
0.235 
0.114 
0.262 
0.296 
0.363 
0.292 
0.223 
0.319 
0.203 
0.292 
0.218 
0.185 
0.115 
0.168 
0.444 
0.282 
0.063 
0.036 
0.006 
0.011 
0.014 
0.021 
0.027 
0.013 
0.128 
0.033 
0.106 
0.088 
0.047 
0.028 
11 116 
0.151 
0.127 
0.198 
0.108 
0.149 
0.054 
0.125 
0.038 
0.152 
0.154 
0.120 
0.026 
0.106 
1013 
0.011 
0 
0 
0 
0.021 
0 
0.002 
0.051 
0.011 
0 
0.018 
0.006 
0.018 
0-003 
0.003 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0 
0.029 
0.031 
0 
0 
0.051 
0.041 
0 
0 
0.014 
0.037 
0.011 
0.058 
0.032 
0.026 
0 
0 
0 
0 
0.071 
0.068 
0 
0 
0.095 
0.064 
0 
0.038 
0.064 
0.015 
0 
0 
"•757 
0.735 
0.714 
0.792 
0.763 
0.723 
*0.703 
0.728 
0.744 
0.696 
0.788 
0.729 
0.657 
0.772 
0.815 
0.801 
0.812 
0.849 
0.796 
0.865 
0.826 
0.850 
0.812 
0.885 
0.864 
0.722 
0.822 
